Funktionelle Analysen AP-2-alpha-abhängiger Genexpression während der Embryonalentwicklung der Maus und Etablierung konditional-defizienter AP-2-alpha-Mauslinien
- Art: Dissertation / Doktorarbeit
- Autor: Ralf Bauerndistel
- Abgabedatum: Dezember 2002
- Umfang: 246 Seiten
- Note: 2,0
- Institution / Hochschule: Universität Fridericiana Karlsruhe (TH) Deutschland
-
ISBN (Paperback) :
978-3-8324-6936-8 P - ISBN (CD) :978-3-8324-6936-8 CD
- Sprache: Deutsch
- Prämierung:
- Arbeit zitieren: Bauerndistel, Ralf Dezember 2002: Funktionelle Analysen AP-2-alpha-abhängiger Genexpression während der Embryonalentwicklung der Maus und Etablierung konditional-defizienter AP-2-alpha-Mauslinien, Hamburg: Diplomica Verlag
- Schlagworte: Transkriptionsfaktor, Neuralleistenzellen, Knockout-Maus, musterbildende Gene, Genetik
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Dissertation / Doktorarbeit von Ralf Bauerndistel
Einleitung:
Zielsetzung dieser Arbeit war es, mittels einer Doppelstrategie die Rolle des Transkriptionsfaktors AP-2-alpha während der Embryonalentwicklung zu untersuchen. In einem ersten Ansatz untersuchte ich mit der Methode der whole-mount in situ-Hybridisierung die Expressionsmuster craniofazialer Markergene während der Organogenese der konstitutiven AP 2-alpha-Knockout-Mutante. In diesem Ansatz wurde Datenmaterial über die prinzipiellen Veränderungen der musterbildenden, genetischen Marker der AP-2-alpha-defizienten Maus erarbeitet. Dabei analysierte ich zuerst die genetischen Musterbildungsprozesse des zentralen Nervensystems unter besonderer Berücksichtigung des Organisationszentrums Mittel- / Hinterhirn-Grenze, des Isthmus.
Im folgenden untersuchte ich die Regionalisierungs- und Spezifizierungsprozesse des Hinterhirns selbst, das Ursprung der metameren Emigration der AP-2-alpha-positiven, cranialen Neuralleistenzellen ist. Weiterhin untersuchte ich die cranialen Neuralleistenzellen während der Migration in das craniale Mesenchym. Nachfolgend untersuchte ich die Prozesse der genetischen Musterbildung der fazialen Region. Dabei unterschied ich zwischen den initialen Induktionssignalen des Ektoderms und den regionalisierenden Markern des Ektomesenchyms und Mesenchyms.
Ausgehend von den erhaltenen Ergebnissen erarbeitete ich weitere Daten über morphologische Details der Knockout-Mutante und konnte so einige der phänotypischen Ausprägungen der AP-2-alpha-Defizienz mit Fehlexpressionen von Markergenen korrelieren.
In einem zweiten Ansatz klonierte ich einen Targetingvektor für die konditionale Inaktivierung des AP-2-alpha-Allels. Ziel war es, eine konditionale AP-2-alpha-Knockout-Mauslinie zu generieren, um die Fragestellungen der konstitutiven Mutante genauer untersuchen zu können. Dafür entwarf ich eine Klonierungsstrategie, die das Exon V des genomischen AP-2-alpha-Lokus mittels des Cre-LoxP-Systems konditional inaktivierbar machte. Nach Elektroporation des Targetingvektors und nach Selektion konnte ich erste ES-Zellklone isolieren und auf homologe Rekombination des Targetingvektors analysieren.
Die in dieser Arbeit dargestellten Daten geben zum ersten Mal einen umfassenden Überblick über die Veränderungen der Expressionen von Markergenen während der Embryonalentwicklung der konstitutiven AP-2-alpha-Knockout-Mausmutante in vivo. Bisherige Studien über die Zielgene der Transkriptionsfaktoren der AP-2-Genfamilie waren hauptsächlich in vitro-Studien. Ausgehend von den erarbeiteten Daten sind konditionaler Targetingvektor und eine konditional-defizienten AP-2-alpha-Knockout-Mauslinie wichtige Werkzeuge, um bisher offene und neu aufgeworfene Fragestellungen der konstitutiven Mutante genauer untersuchen zu können.
Inhaltsverzeichnis:
| 1. | Einleitung | 1 |
| 1.1 | Die Familie der AP-2-Transkriptionsfaktoren | 1 |
| 1.2 | Der Transkriptionsfaktor AP-2 - Mediator zwischen Signalübertragung und gewebsspezifischer, differentieller Genexpression | 2 |
| 1.3 | Die AP-2-Transkriptionsfaktoren während der Embryonalentwicklung der Maus | 3 |
| 1.4 | Der Transkriptionsfaktor AP-2-alpha während der Embryonalentwicklung der Maus - Der Phänotyp der AP-2-alpha-Knockout-Mutante | 5 |
| 1.5 | Morphologische Entwicklung und genetische Musterbildung im zentralen Nervensystem der Maus - Generation der cranialen Neuralleistenzellen | 7 |
| 1.6 | Genetische Musterbildung, Regionalisierung und Differenzierung der craniofazialen Region der Maus - Einfluß der cranialen Neuralleistenzellen | 13 |
| 1.7 | Die Zahnentwicklung während der Organogenese der Maus - Symmetrische Ausprägungen der Regionalisierungs- und Spezifizierungsprozesse während der craniofazialen Morphogenese | 21 |
| 1.8 | Die Augenentwicklung während der Organogenese der Maus - Symmetrische Ausprägungen der Regionalisierungs- und Spezifizierungsprozesse während der craniofaziale Morphogenese | 24 |
| 1.9 | Die Entwicklung des Innenohres während der Organogenese der Maus | 26 |
| 1.10 | Gen-Targeting - Zielgerichtete Mutagenese des Mausgenoms | 27 |
| 1.11 | Prinzipieller Aufbau eines Knockout-Targetingvektors | 28 |
| 1.12 | Grenzen des herkömmlichen Gentargetings | 29 |
| 1.13 | Das Cre-/LoxP-System - Erweiterung der herkömmlichen Knockout-Techniken | 30 |
| 1.14 | Das konditionale Gentargeting - Neue Möglichkeiten mit dem Cre-/LoxP-System | 31 |
| 1.15 | Zielsetzung | 33 |
| 2. | Material und Methoden | 34 |
| 2.1 | Material | 34 |
| 2.1.1 | Antikörper | 34 |
| 2.1.2 | Bezugsquellen diverser Verbrauchsmaterialien und Chemikalien | 34 |
| 2.1.3 | Datenbanken | 37 |
| 2.1.4 | Embryonale Stammzellen (ES-Zellen) | 38 |
| 2.1.5 | Enzyme | 38 |
| 2.1.6 | Hard- und Software | 39 |
| 2.1.7 | Kompetente Bakterien | 40 |
| 2.1.8 | Mäuse und Embryonen | 40 |
| 2.1.9 | Oligonukleotide/Primer | 41 |
| 2.1.10 | Plasmide | 42 |
| 2.1.11 | Radiochemikalien | 44 |
| 2.1.12 | Selektionskassette | 44 |
| 2.1.13 | Medien, Puffer und Lösungen | 45 |
| 2.2 | Methoden | 49 |
| 2.2.1 | Auftrennung, Isolierung, Reinigung und Analyse von Nukleinsäuren | 49 |
| 2.2.2 | Allgemeine Klonierungstechniken | 54 |
| 2.2.3 | Spezielle Klonierungstechniken | 58 |
| 2.2.4 | Sequenzieren von DNA | 61 |
| 2.2.5 | Präparation von Nukleinsäuren aus Bakterien- und Zellkulturen oder embryonalen Geweben | 66 |
| 2.2.6 | ES-Zellkultur | 69 |
| 2.2.7 | Analyse von ES-Zellklonen mittels Southern-Blot | 73 |
| 2.2.8 | Mäuse und Embryonen | 76 |
| 2.2.9 | Analyse der Embryonen mittels whole-mount in situ Hybridisierung (ISH) und Anfertigung mikroskopischer Schnittpräparate | 79 |
| 3. | Ergebnisse | 86 |
| 3.1 | Analysen der genetischen Musterbildungsprozesse der craniofazialen Region der konstitutiven AP-2-alpha-Knockout-Mutante | 86 |
| 3.1.1 | Ergebnisse der Untersuchungen der genetischen Musterbildung und Spezifikation des zentralen Nervensystems der konstitutiven AP-2-alpha-Mutante | 87 |
| 3.1.2 | Ergebnisse der Untersuchungen an genetischer Musterbildung, Regionalisierung und Differenzierung der craniofazialen Region der konstitutiven AP-2-alpha Mutante | 102 |
| 3.1.3 | Übersicht über die Ergebnisse | 130 |
| 3.1.4 | Ergebnisse der Untersuchungen der Zahnanlagen der konstitutiven AP-2-Knockout-Mutante | 134 |
| 3.1.5 | Status der Generierung einer konditional-defizienten AP-2-alpha-Mauslinie | 138 |
| 3.2.1 | Klonierungsstrategie des konditionalen AP-2-alpha-Targetingvektors | 138 |
| 3.2.2 | Sequenzierungen zur Überprüfung des konditionalen AP-2-alpha-Targetingvektors | 144 |
| 3.2.3 | Vergleich der Sequenzen des konditionalen AP-2-alpha-Targetingvektors mit den Daten des Mausgenoms verschiedener Datenbanken | 147 |
| 3.2.4 | Rekombination des konditionalen AP-2-alpha-Targetingvektors in embryonalen Stammzellen | 149 |
| 3.2.5 | Status der Analyse der ES-Zellklone auf homologe Rekombination des konditionalen AP-2-alpha-Targetingvektors mittels Southern-Blot | 149 |
| 4. | Diskussion | 152 |
| 4.1 | Zielsetzung | 152 |
| 4.2 | Analysen der genetischen Musterbildungsprozesse der craniofazialen Region der konstitutiven AP-2-alpha-Knockout-Mutante | 153 |
| 4.2.1 | Untersuchungen der genetischen Musterbildung des Vorder- und Mittelhirns der konstitutiven AP-2-alpha-Knockout-Mutante | 153 |
| 4.2.2 | Untersuchungen der genetischen Musterbildung des Rhombencephalons und der Migration der cranialen Neuralleistenzellen der konstitutiven AP-2-alpha-Mutante | 157 |
| 4.2.3 | Untersuchungen der genetischen Musterbildung, Regionalisierung und Differenzierung der craniofazialen Region der konstitutiven AP-2-alpha-Mutante | 161 |
| 4.4 | Ausblick | 173 |
| 5. | Literaturverzeichnis | 176 |
| 6. | Anhang | 205 |
| 6.1 | Gesamt-Sequenzierung eines Klons nach der Insertion der singulären LoxP-Site durch die Firma MWG, Heidelberg | 205 |
| 6.2 | Sequenzierung mehrerer Klone zur Überprüfung der Orientierung der LTNL-Selektionskassette | 206 |
| 6.3 | Sequenzierung mehrerer Klone zur Überprüfung der 3´-homologen Region des Targetingvektors | 207 |
| 6.4 | Sequenz der Firma MWG, Heidelberg verglichen mit einem Auszug aus dem Contig der Celera-Datenbank | 207 |
| 6.5 | Sequenz der Firma MWG, Heidelberg verglichen mit dem Contig der EnsEMBL-Datenbank | 212 |
| 6.6 | Sequenz des Contigs der EnsEMBL-Datenbank mit einem Auszug aus dem Contig der Celera-Datenbank | 216 |
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Link zur Arbeit:
http://www.diplom.de/ean/9783832469368
Arbeit zitieren:
Bauerndistel, Ralf Dezember 2002: Funktionelle Analysen AP-2-alpha-abhängiger Genexpression während der Embryonalentwicklung der Maus und Etablierung konditional-defizienter AP-2-alpha-Mauslinien, Hamburg: Diplomica Verlag
Schlagworte:
Transkriptionsfaktor, Neuralleistenzellen, Knockout-Maus, musterbildende Gene, Genetik



