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Funktionelle Analysen AP-2-alpha-abhängiger Genexpression während der Embryonalentwicklung der Maus und Etablierung konditional-defizienter AP-2-alpha-Mauslinien

Funktionelle Analysen AP-2-alpha-abhängiger Genexpression während der Embryonalentwicklung der Maus und Etablierung konditional-defizienter AP-2-alpha-Mauslinien
Über dieses Buch
  • Art: Dissertation / Doktorarbeit
  • Autor: Ralf Bauerndistel
  • Abgabedatum: Dezember 2002
  • Umfang: 246 Seiten
  • Note: 2,0
  • Institution / Hochschule: Universität Fridericiana Karlsruhe (TH) Deutschland
  • ISBN (Paperback) :
    978-3-8324-6936-8 P
  • ISBN (CD) :978-3-8324-6936-8 CD
  • Sprache: Deutsch
  • Prämierung:
  • Arbeit zitieren: Bauerndistel, Ralf Dezember 2002: Funktionelle Analysen AP-2-alpha-abhängiger Genexpression während der Embryonalentwicklung der Maus und Etablierung konditional-defizienter AP-2-alpha-Mauslinien, Hamburg: Diplomica Verlag
  • Schlagworte: Transkriptionsfaktor, Neuralleistenzellen, Knockout-Maus, musterbildende Gene, Genetik

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Dissertation / Doktorarbeit von Ralf Bauerndistel

Einleitung:

Zielsetzung dieser Arbeit war es, mittels einer Doppelstrategie die Rolle des Transkriptionsfaktors AP-2-alpha während der Embryonalentwicklung zu untersuchen. In einem ersten Ansatz untersuchte ich mit der Methode der whole-mount in situ-Hybridisierung die Expressionsmuster craniofazialer Markergene während der Organogenese der konstitutiven AP 2-alpha-Knockout-Mutante. In diesem Ansatz wurde Datenmaterial über die prinzipiellen Veränderungen der musterbildenden, genetischen Marker der AP-2-alpha-defizienten Maus erarbeitet. Dabei analysierte ich zuerst die genetischen Musterbildungsprozesse des zentralen Nervensystems unter besonderer Berücksichtigung des Organisationszentrums Mittel- / Hinterhirn-Grenze, des Isthmus.

Im folgenden untersuchte ich die Regionalisierungs- und Spezifizierungsprozesse des Hinterhirns selbst, das Ursprung der metameren Emigration der AP-2-alpha-positiven, cranialen Neuralleistenzellen ist. Weiterhin untersuchte ich die cranialen Neuralleistenzellen während der Migration in das craniale Mesenchym. Nachfolgend untersuchte ich die Prozesse der genetischen Musterbildung der fazialen Region. Dabei unterschied ich zwischen den initialen Induktionssignalen des Ektoderms und den regionalisierenden Markern des Ektomesenchyms und Mesenchyms.

Ausgehend von den erhaltenen Ergebnissen erarbeitete ich weitere Daten über morphologische Details der Knockout-Mutante und konnte so einige der phänotypischen Ausprägungen der AP-2-alpha-Defizienz mit Fehlexpressionen von Markergenen korrelieren.

In einem zweiten Ansatz klonierte ich einen Targetingvektor für die konditionale Inaktivierung des AP-2-alpha-Allels. Ziel war es, eine konditionale AP-2-alpha-Knockout-Mauslinie zu generieren, um die Fragestellungen der konstitutiven Mutante genauer untersuchen zu können. Dafür entwarf ich eine Klonierungsstrategie, die das Exon V des genomischen AP-2-alpha-Lokus mittels des Cre-LoxP-Systems konditional inaktivierbar machte. Nach Elektroporation des Targetingvektors und nach Selektion konnte ich erste ES-Zellklone isolieren und auf homologe Rekombination des Targetingvektors analysieren.

Die in dieser Arbeit dargestellten Daten geben zum ersten Mal einen umfassenden Überblick über die Veränderungen der Expressionen von Markergenen während der Embryonalentwicklung der konstitutiven AP-2-alpha-Knockout-Mausmutante in vivo. Bisherige Studien über die Zielgene der Transkriptionsfaktoren der AP-2-Genfamilie waren hauptsächlich in vitro-Studien. Ausgehend von den erarbeiteten Daten sind konditionaler Targetingvektor und eine konditional-defizienten AP-2-alpha-Knockout-Mauslinie wichtige Werkzeuge, um bisher offene und neu aufgeworfene Fragestellungen der konstitutiven Mutante genauer untersuchen zu können.

Inhaltsverzeichnis:

1. Einleitung 1
1.1 Die Familie der AP-2-Transkriptionsfaktoren 1
1.2 Der Transkriptionsfaktor AP-2 - Mediator zwischen Signalübertragung und gewebsspezifischer, differentieller Genexpression 2
1.3 Die AP-2-Transkriptionsfaktoren während der Embryonalentwicklung der Maus 3
1.4 Der Transkriptionsfaktor AP-2-alpha während der Embryonalentwicklung der Maus - Der Phänotyp der AP-2-alpha-Knockout-Mutante 5
1.5 Morphologische Entwicklung und genetische Musterbildung im zentralen Nervensystem der Maus - Generation der cranialen Neuralleistenzellen 7
1.6 Genetische Musterbildung, Regionalisierung und Differenzierung der craniofazialen Region der Maus - Einfluß der cranialen Neuralleistenzellen 13
1.7 Die Zahnentwicklung während der Organogenese der Maus - Symmetrische Ausprägungen der Regionalisierungs- und Spezifizierungsprozesse während der craniofazialen Morphogenese 21
1.8 Die Augenentwicklung während der Organogenese der Maus - Symmetrische Ausprägungen der Regionalisierungs- und Spezifizierungsprozesse während der craniofaziale Morphogenese 24
1.9 Die Entwicklung des Innenohres während der Organogenese der Maus 26
1.10 Gen-Targeting - Zielgerichtete Mutagenese des Mausgenoms 27
1.11 Prinzipieller Aufbau eines Knockout-Targetingvektors 28
1.12 Grenzen des herkömmlichen Gentargetings 29
1.13 Das Cre-/LoxP-System - Erweiterung der herkömmlichen Knockout-Techniken 30
1.14 Das konditionale Gentargeting - Neue Möglichkeiten mit dem Cre-/LoxP-System 31
1.15 Zielsetzung 33
2. Material und Methoden 34
2.1 Material 34
2.1.1 Antikörper 34
2.1.2 Bezugsquellen diverser Verbrauchsmaterialien und Chemikalien 34
2.1.3 Datenbanken 37
2.1.4 Embryonale Stammzellen (ES-Zellen) 38
2.1.5 Enzyme 38
2.1.6 Hard- und Software 39
2.1.7 Kompetente Bakterien 40
2.1.8 Mäuse und Embryonen 40
2.1.9 Oligonukleotide/Primer 41
2.1.10 Plasmide 42
2.1.11 Radiochemikalien 44
2.1.12 Selektionskassette 44
2.1.13 Medien, Puffer und Lösungen 45
2.2 Methoden 49
2.2.1 Auftrennung, Isolierung, Reinigung und Analyse von Nukleinsäuren 49
2.2.2 Allgemeine Klonierungstechniken 54
2.2.3 Spezielle Klonierungstechniken 58
2.2.4 Sequenzieren von DNA 61
2.2.5 Präparation von Nukleinsäuren aus Bakterien- und Zellkulturen oder embryonalen Geweben 66
2.2.6 ES-Zellkultur 69
2.2.7 Analyse von ES-Zellklonen mittels Southern-Blot 73
2.2.8 Mäuse und Embryonen 76
2.2.9 Analyse der Embryonen mittels whole-mount in situ Hybridisierung (ISH) und Anfertigung mikroskopischer Schnittpräparate 79
3. Ergebnisse 86
3.1 Analysen der genetischen Musterbildungsprozesse der craniofazialen Region der konstitutiven AP-2-alpha-Knockout-Mutante 86
3.1.1 Ergebnisse der Untersuchungen der genetischen Musterbildung und Spezifikation des zentralen Nervensystems der konstitutiven AP-2-alpha-Mutante 87
3.1.2 Ergebnisse der Untersuchungen an genetischer Musterbildung, Regionalisierung und Differenzierung der craniofazialen Region der konstitutiven AP-2-alpha Mutante 102
3.1.3 Übersicht über die Ergebnisse 130
3.1.4 Ergebnisse der Untersuchungen der Zahnanlagen der konstitutiven AP-2-Knockout-Mutante 134
3.1.5 Status der Generierung einer konditional-defizienten AP-2-alpha-Mauslinie 138
3.2.1 Klonierungsstrategie des konditionalen AP-2-alpha-Targetingvektors 138
3.2.2 Sequenzierungen zur Überprüfung des konditionalen AP-2-alpha-Targetingvektors 144
3.2.3 Vergleich der Sequenzen des konditionalen AP-2-alpha-Targetingvektors mit den Daten des Mausgenoms verschiedener Datenbanken 147
3.2.4 Rekombination des konditionalen AP-2-alpha-Targetingvektors in embryonalen Stammzellen 149
3.2.5 Status der Analyse der ES-Zellklone auf homologe Rekombination des konditionalen AP-2-alpha-Targetingvektors mittels Southern-Blot 149
4. Diskussion 152
4.1 Zielsetzung 152
4.2 Analysen der genetischen Musterbildungsprozesse der craniofazialen Region der konstitutiven AP-2-alpha-Knockout-Mutante 153
4.2.1 Untersuchungen der genetischen Musterbildung des Vorder- und Mittelhirns der konstitutiven AP-2-alpha-Knockout-Mutante 153
4.2.2 Untersuchungen der genetischen Musterbildung des Rhombencephalons und der Migration der cranialen Neuralleistenzellen der konstitutiven AP-2-alpha-Mutante 157
4.2.3 Untersuchungen der genetischen Musterbildung, Regionalisierung und Differenzierung der craniofazialen Region der konstitutiven AP-2-alpha-Mutante 161
4.4 Ausblick 173
5. Literaturverzeichnis 176
6. Anhang 205
6.1 Gesamt-Sequenzierung eines Klons nach der Insertion der singulären LoxP-Site durch die Firma MWG, Heidelberg 205
6.2 Sequenzierung mehrerer Klone zur Überprüfung der Orientierung der LTNL-Selektionskassette 206
6.3 Sequenzierung mehrerer Klone zur Überprüfung der 3´-homologen Region des Targetingvektors 207
6.4 Sequenz der Firma MWG, Heidelberg verglichen mit einem Auszug aus dem Contig der Celera-Datenbank 207
6.5 Sequenz der Firma MWG, Heidelberg verglichen mit dem Contig der EnsEMBL-Datenbank 212
6.6 Sequenz des Contigs der EnsEMBL-Datenbank mit einem Auszug aus dem Contig der Celera-Datenbank 216

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Arbeit zitieren:
Bauerndistel, Ralf Dezember 2002: Funktionelle Analysen AP-2-alpha-abhängiger Genexpression während der Embryonalentwicklung der Maus und Etablierung konditional-defizienter AP-2-alpha-Mauslinien, Hamburg: Diplomica Verlag

Schlagworte:
Transkriptionsfaktor, Neuralleistenzellen, Knockout-Maus, musterbildende Gene, Genetik

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